Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh là đơn vị sự nghiệp trực thuộc Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch, được thành lập theo Quyết định số 112/UB, ngày 24 tháng 4 năm 1997 của Chủ tịch UBND tỉnh Bắc Ninh. Năm 1999, Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh được xếp hạng Hạng III, năm 2012 được xếp Hạng II trong hệ thống bảo tàng Việt Nam.

    Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng theo quy định của pháp luật. Trụ sở của Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh đặt tại số 02 đường Lý Thái Tổ, phường Suối Hoa, thành phố Bắc Ninh với tổng diện tích hơn 22.000 m2. Hiện nay cơ cấu tổ chức của Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh gồm Ban lãnh đạo (Giám đốc và 02 Phó giám đốc) và 2 phòng chức năng (Hành chính-Tổng hợp; Nghiệp vụ) với tổng số 24 viên chức và lao động hợp đồng. Phần lớn viên chức trong độ tuổi trẻ, có trình độ chuyên môn phù hợp với vị trí việc làm.

   Kể từ khi thành lập cho đến nay, Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh luôn được sự quan tâm của Tỉnh ủy, UBND tỉnh Bắc Ninh; sự chỉ đạo, hướng dẫn trực tiếp của Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch về chuyên môn nghiệp vụ và đã đạt được một số kết quả tiêu biểu: xuất bản được 10 đầu sách, tái bản chỉnh sửa bổ sung 2 đầu sách, thực hiện 07 đề tài khoa học cấp tỉnh, tổ chức 08 cuộc thám sát khảo cổ học, tổ chức 58 cuộc trưng bày, triển lãm chuyên đề tại bảo tàng và lưu động tại các địa phương, đón tiếp hơn 500 nghìn lượt khách tham quan; đặc biệt công tác sưu tầm tài liệu hiện vật được quan tâm nên tổng số tài liệu hiện vật trong kho bảo tàng hiện lên tới gần 22 nghìn tài liệu, hiện vật, trong đó có nhiều cổ vật qúy hiếm, độc đáo.

Trong tháng 12 năm 2022, Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh tiếp nhận nhiều tài liệu hiện vật quý do Chính quyền thôn Đông Cao, xã Đông Cứu, huyện Gia Bình; Công ty Cổ phần Quản lý đường sông số 4 trực thuộc Cục Đường thủy Nội địa Việt Nam và Đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc trao tặng, bao gồm:

       - 01 Bát hương đồng thế kỷ XIX - XX ở chùa Đông Cao, xã Đông Cứu, huyện Gia Bình.

       - 01 Mõ gỗ thời Nguyễn ở chùa Đông Cao, xã Đông Cứu, huyện Gia Bình.

      - 01 Tàu sắt rà phá bom từ trường không người lái T5A sản xuất năm 1972 dùng để rà phá bom từ trường trên sông Đuống (đoạn Chi Nhị - Đào Viên) từ  năm 1972 đến năm 1975.

       - 01 Lá cờ truyền thống của Tỉnh Đảng bộ Đảng Lao động Việt Nam tỉnh Hà Bắc trao tặng Đội TNXP N297 Đề Thám mang dòng chữ “hoàn thành nhiệm vụ chiến đấu thắng lợi” (hiện vật phục chế theo tỉ lệ 1:1 lá cờ đang lưu giữ tại Bảo tàng tỉnh Bắc Giang).

       - 01 Lá cờ truyền thống của Bộ Tư lệnh Đoàn 559 tặng Đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc đơn vi dẫn đầu làm nhiệm vụ mở đường 3 năm 1972 - 1975 (hiện vật phục chế theo tỉ lệ 1:1 lá cờ đang lưu giữ tại Bảo tàng tỉnh Bắc Giang).

       - 01 Bằng Quyết định số 211/QĐ-CTN ngày 22/02/2010 của Chủ tịch nước Cộng hòa Xã hội Chủ nghĩa Việt Nam tặng danh hiệu Anh hùng Lực lượng vũ trang nhân dân cho đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc 193 - 559 (hiện vật phục chế theo tỉ lệ 1:1 lá cờ đang lưu giữ tại Bảo tàng tỉnh Bắc Giang).

       - 01 Cờ của Chủ tịch nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Việt Nam phong tặng danh hiệu Anh hùng Lực lượng vũ trang nhân dân cho đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc 193 - 559 (hiện vật phục chế theo tỉ lệ 1:1 lá cờ đang lưu giữ tại Bảo tàng tỉnh Bắc Giang).

       - 01 Lá cờ truyền thống của Đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc 193 - 559 (hiện vật phục chế theo tỉ lệ 1:1 lá cờ đang lưu giữ tại Bảo tàng tỉnh Bắc Giang).

       - 01 Ảnh tư liệu truyền thống Đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc 193 - 559 gặp mặt truyền thống đơn vị 50 năm  (1972 - 2022).

       - 01 Ảnh tư liệu Cựu TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc 193 - 559 giáo dục truyền thống cách mạng cho học sinh Trung tâm giáo dục nghề nghiệp giáo dục thường xuyên huyện Yên Dũng.

       Đây là những hiện vật vô cùng giá trị phản ánh về di sản văn hóa Phật giáo và truyền thống đấu tranh cách mạng của quân và dân Bắc Ninh trong cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước. Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh trân trọng và ghi nhận việc làm thiết thực, ý nghĩa của Chính quyền thôn Đông Cao, xã Đông Cứu, huyện Gia Bình; Ban lãnh đạo Công ty Cổ phần Quản lý đường sông số và Đội TNXP N297 Đề Thám Hà Bắc trong việc hiến tặng tài liệu hiện vật cho Bảo tàng tỉnh, góp phần vào việc bảo tồn và phát huy giá trị di sản văn hóa của quê hương Bắc Ninh.

   Với vị trí thuận lợi, cơ sở vật chất đồng bộ, có nhiều cố gắng trong các hoạt động, Bảo tàng tỉnh Bắc Ninh đang từng bước đáp ứng nhu cầu nghiên cứu, tham quan học tập của công chúng về di sản văn hóa, là điểm đến hấp dẫn của du khách khi đến Bắc Ninh.