Chùa Thanh Sơn là một điểm di tích nằm trong Quần thể di tích danh thắng Hương Sơn. So với chùa Thiên Trù hay động Hương Tích, Chùa Thanh Sơn không phải là điểm được nhắc đến nhiều nhất trong hành trình Chùa Hương, nhưng lại có vị trí riêng trong hệ thống chùa, động và cảnh quan gắn với Suối Yến.
Theo các tư liệu được lưu truyền, Chùa Thanh Sơn được hình thành vào năm Canh Thân 1860.