Chùa Hạ Yên Quyết có tên chữ là Ngọc Quán tự, dân gian thường gọi là chùa Cót. Tên gọi chùa Cót xuất phát từ tên Nôm của làng Hạ Yên Quyết – một làng cổ nằm bên hữu ngạn sông Tô Lịch. Chùa nhìn về hướng Tây Nam, phía sau hướng về khu vực sông Tô Lịch và chùa Láng. Dù nằm giữa khu dân cư đô thị đông đúc, khuôn viên chùa vẫn giữ được hệ thống cây xanh, hồ nước và khoảng sân rộng, tạo nên một không gian tương đối biệt lập, yên tĩnh.